集菌仪是集菌培养器的配套使用仪器，通过集菌仪的定向蠕动加压作用，供试品被正压过滤并在滤器内进行培养，以检验供试品是否含菌。集菌仪的作用是检验供试品是否含菌的仪器，符合2020年版中国药典无菌检查薄膜过滤法。

其检测方法为：供试品通过进样管道连续被注入集菌培养器中，利用集菌培养器内形成的下压，通过微米孔径的滤膜过滤，供试品中可能存在的微生物被截留收集在滤膜上，通过冲洗滤膜除去供试品的抑菌成分。然后把所需培养基通过进样管道直接注入集菌培养器中，放置规定的温度培养，观察是否有长菌现象。

设备采用镜面不锈钢一体化设计，提高仪器的使用寿命，同时降低因传统集菌仪表面生锈问题造成的维修、更换等产生的成本，避免了因为化学物质对表面的腐蚀，机壳表面设计不留任何死角，解决了无菌室或微生物室高洁净仪器的要求。